一、完工制及繳庫制之區別及內控流程：
（一）完工制：乃由製造部(車間)最後製程人員自行增寫或輸入完工單，車間最後製程人員或車間報表員根據每一製令單號(即批號)施工、完工並逐批盤點後，即依序拋轉輸入完工單，系統操作上可以分次拋轉輸入完工單或整批拋轉輸入完工單，列印時一式三聯：車間聯、倉管聯及品管聯，輸入人員於三聯完工單上簽字後交由倉管員點收並簽收入庫後，通知品管員於三聯完工單上簽字，品管員留存一份，其餘二聯退回倉管員及車間最後製程人員或報表員，ERP完工單之核准輸入由車間為之.。採用完工制時，最後製程人員不但需輸入生管日報，尚且需輸入完工單，為了避免重覆工作，可以在系統參數選擇完工單之產生方式為”依據員工日報自動產生”或依據”生產線生產日報自動產生”均可，視生產日報輸入之種類選擇而定。
（二） 繳庫制：此制度下，生管部列印製令單或製令製程單必須預留倉管聯，通知倉管員按每張製令單上的預計完工日監督完工進度，催繳入庫。車間最後製程人員將產品製造完工後，攜帶製令單或製令製程單，連同實體完工產品，送交倉管部報工繳庫，倉管員遇有車間前來報工繳庫時，立即清點實體產品完工數量後，即刻拋轉輸入完工單，列印一式三聯：車間聯、倉管聯及品管聯，倉管員及車間報工繳庫人員於此三聯完工單及車間攜來的製令單或製令製程單上簽字，再通知品管部於此三聯完工單上簽字後，品管部自留一聯，餘倉管聯及車間聯，則交還倉管部及車間，ERP完工單之”核准”輸入由倉管部為之。

二、剩餘料、水口料(含邊料、下腳料及廢料)及殘料之處理：內部控制上，應於每一製令”完工”且”結案”的時間點對剩餘料、水口料及殘料作一個清盤處理，這才符合ISO精神及5 S精神：不需要的東西不要放在現場妨礙工效率。而內控觀點，每一製令單需要作清盤處理的理由是：
（一）避免餘料方便挪用至下一張製令單，造成第一張製令用料成本高估，而第二張製令用料成本則被低估，如此一來，每一製令單所結出來的成本便失去真實性。
（二）不清盤將餘料退至倉庫，則系統無法納入MRP的庫存計算，會導致超額生產或超額採購的負面管理。
（三）不清盤退庫的餘料是管理上的死角，若車間員工將之作對公司不利之處份，倉管無從知悉，故應迅速將之納入管理。

   原來管理上的課題這麼多，再再都需要勤快地處理，管理諺語：真正的管理者必是勤勞者。懶惰的管理者會讓公司陷入極端的無效率、浪費、錯誤、矛盾、磨擦，甚至舞弊。
（一）剩餘料之處理：所謂剩餘料是指外觀、性質、價格及原料品號均不改變的剩餘料，假設材料編號是B8712，則原領料單所領材料品號是B8712，退料單上所退材料品號也是B8712。此情況需操作退料單輸入SRMOI104的程式，單別為TB1(廠內退料單)或TB2(委外退料單)，TB1及TB2所退材料，在程式上可勾選其原來之領料單後，再輸入退料數量及退料倉別即可。內控流程如下：在領料製下，退料單(TB1)由車間退料人員，持原領料單及該製令之實體餘料，請車間報表員輸入退料單，列印一式二聯，車間聯及倉管聯，車間退料人員於二聯退料單上簽字後，持退料單及實體餘料至倉管繳庫，倉管亦須於退單料上簽字後自留一份，另一份退回給車間退料人員。在發料制下，車間退料人員須持原領料單及實體餘料至倉庫要求退料，倉管員輸入退料單後，列印二聯，收繳餘料後請車間退料人員簽字取走一聯，自己保存一聯。
（二）水口料之處理：水口料包含邊料、下腳料及廢料，它們的共同特徵是外觀、性質、價格、原料品號均已改變，假設材料編號是B8712，原領料單所領材料品號是B8712，退料單上所退材料品號卻是S-B8712，此情形下的退料，帥將ERP的系統邏輯上，須輸入廠內無領料退料SRMOI144(單別為TB7)，或委外無領料退料SRMOI148(單別為TB8)，無領料退料單最大的特徵在於輸入時只能勾選原製令單號(無法勾選原領料單號)，且系統設計上，在單價基礎，第一順位自動抓期初月加權單價，其次可勾選建在品號基本資料的標準進價，也可以自行輸入單價，單價為”0 “時，無領料退料單無法儲存，這是重要的控制點，須交給電腦來把關即時處理，否則結算庫存成本或產品成本發現有異常，再補單價，就會浪費10倍時間，此控制點可以使該張製令的用料成本恰如其分地扣除無領料退料品號的金額，同時庫存系統亦增加一筆對應的庫存數量及金額。其內控流程與第(一)點雷同，但需持原製令單及水口料實體物品去退料，而非持原領料單，且有新水口料品號基本資料建檔的問題要考慮，內控流程如下：在領料製下，退料單(TB1)由車間退料人員，持原製令單及該製令之實體餘料，請車間報表員輸入退料單，列印一式二聯，車間聯及倉管聯，車間退料人員於二聯退料單上簽字後，持退料單及實體餘料至倉管繳庫，倉管亦須於退單料上簽字後自留一份，另一份退回給車間退料人員。在發料制下，車間退料人員須持原製令單及實體餘料至倉庫要求退料，倉管員輸入退料單後，列印二聯，收繳餘料後請車間退料人員簽字取走一聯，自己保存一聯。
（三）殘料是介於剩餘料及水口料兩者之間，通常發生在材料必須裁切時，由大變小，譬如原來的規格鋼板是規格厚2.0mm，規格寬2m，規格長10m，厚與寬不變，但長度被裁切後剩餘長度4m被退庫，此情形，你可以說是退回GB 2.0 × 03 × 10 的材料品號0.4片，或者說你退回GB 2.0 × 03 × 04的材料品號1片。前者不須另編材料品號，但不精確，後者需新增材料品號，較麻煩，但庫存管理比較精確。以上二種選擇須視材料特性、加工變化、廠地配置等實際狀況決定之，前者乃輸入一般退料單，後者是輸入無領料退料單。
（四）水口料、廢料、下腳料若材料特性、製造特性或機器特性、場地特性或成本效益不經濟等因素致無法按製令單逐批辨認退料數量，則可利用帥將ERP中下列便利程式及作法：
  （1）在每一產品品號基本檔建立該產品之水口料品號(廢料、下腳料)及每一產品所產生的水口料標準數量或重量及退料倉庫代號。
  （2）執行廢料自動產生無領料退料單作業，即可彙總或逐批產生水口料的無領料退料單。平常實體退料作業可以每天或每週集中退料一次，實物流或帳物流暫時脫勾。
  （3）水口料本身也是材料品號之一種，可以被領料、銷售、移倉、調整或其他出入庫異動。
  （4）執行庫存月結後作業程式，再重點式盤點帳面水口料數量與實際水口數量之差異，差異數可以輸入AD1或AD2的庫存調整加項單(盤盈單)，及庫存調整減項單(盤盈單)，會計科目設定為存貨盤盈或存貨盤虧；差異數也可以輸入其他庫存異動單，會計科目設定為”其他營業成本調整項目”。此時又將實物流與帳物流結合為一。